故事叙述一个巧妙的契机，在泰瑞进入飞哥小佛家五周年纪念日当天，飞哥做了一个用大型鸭嘴兽羽毛球机器，而且两人就坐在里头，在阴错阳差之下撞上了背着两人驾着火箭车出任务的泰瑞，意外弹到了杜芬舒斯家中，飞哥与小佛因此结识了杜芬舒斯，并帮杜芬舒斯修好被他们撞烂的”超时空终结者”，刚好泰瑞在此时闯进杜芬舒斯家，因为不能被家中主人发现，所以只好变回毫无威胁性的鸭嘴兽。飞哥帮忙修好机器后，一行人进入了另一个时空。那个时空是一个被穿黑袍的独眼杜芬舒斯独裁统治的三州地区，莫来管队长则成了独眼杜芬舒斯底下的助理。
独眼杜芬舒斯把自己那个时空的鸭嘴兽泰瑞给改造成了自己的邪恶部属，而此时泰瑞也在情急之下暴露了自己的身分，秘密特务的身分让飞哥很不谅解，他把泰瑞当成家人，而家人是不该有秘密的，独眼杜芬舒斯命令机械鸭嘴兽去攻击鸭嘴兽泰瑞，在经过一番缠斗之后暂时甩掉了他，但鸭嘴兽泰瑞却想独自去对付独眼杜芬舒斯却失败被俘，飞哥想回到自己的时空，但是时空终结者的遥控器却失灵了，于是他们去找属于那个时空的自己，却发现另一个自己却和本身判若两人，毫无想像力，而且不知道暑假是什么。
于是他们又去找了那个时空的伊莎贝拉，发现伊莎贝拉是杜芬反抗军的一名军官，而飞哥的朋友们在那个时空也都成了反抗军的一员，凯蒂斯则是反抗军头领。另一方面独眼杜芬舒斯听了杜芬舒斯所叙述的另一个三州地区，于是想利用时空终结者到飞哥本来的时空进行大规模侵略，但是杜芬舒斯却忘了怎么启动，独眼杜芬舒斯只好利用手上的鸭嘴兽泰瑞当人质把飞哥他们全抓过来，杜芬舒斯在此时想起了如何改造，开启了时空之门，但独眼杜芬舒斯却因为杜芬舒斯过于懦弱，所以把他连同飞哥他们一起送去喂怪兽，此时那个时空的凯蒂斯救了他们，并用时空之门展开大逃亡。
逃回了自己的时空，却发现独眼杜芬舒斯的机器大军也入侵了自己的家园，于是他们找到藏在家里的密道，找到鸭嘴兽泰瑞留下来的秘密武器，原来是飞哥他们在暑假做的所有发明，两个时空的人用飞哥的发明合力击退了独眼杜芬舒斯的机械军团，飞哥摧毁了机器人的主控制台，让机器人全部当机，而压嘴兽泰瑞也打败了机械泰瑞，消除它的邪恶思想。杜芬舒斯用独眼杜芬舒斯最心爱的玩具火车头把他引回属于他的时空，并被反抗军和莫来管所擒。
因为泰瑞暴露了自己的身分，所以必须遣往别处，凯尔建议用杜芬舒斯的记忆终结者消除他们的记忆，飞哥因为这一连串经历过于精彩所以舍不得删除，但小佛提醒他美好的记忆可以自己创造，但泰瑞只有一只，所以选择删除记忆，一切又回复正常。(在记意删除前,伊莎贝拉亲了飞哥一下)
“对于好奇心重的人来说，没有比陌生的地方更好的地儿了。”这部电影对于有理想和信仰、爱学习的东亚观众来说，其实很有启发。丁若铨和昌大这对师生，一个为志趣另一个为功名，在碰撞中，这两位读书人都得到了成长。人各有志，但读书必有收获，见识能改变人如何看待自己的命运，追求本心，才是最重要的。看这部电影会立马能想到苏东坡，以及他被流放到儋州，教出海南高才生的故事。希望中国也有类似这样风格、有能力的导演去拍一拍苏东坡。
我只觉得有点不好，昌大的暴掐收税官未免也太戏剧冲突了吧，难道他当贱民时没有见过苛收赋利吗？等到做官了才突然发现吗？那可真是活在象牙塔里的少年啊！
我还以为是“鱼类菜谱”呢，其实是海洋生物百科全书。朝鲜王朝后期文臣丁若铨因信奉天主教被流放至黑山岛，渐与岛民昌大形成亦师亦友的关系。丁若铨被流放14年后死于黑山岛，死前终于写完《兹山鱼谱》。丁若铨教昌大学文认字，昌大教丁若铨认识了解各种海洋生物。昌大学成后与丁若铨的理念产生分歧，丁若铨早已看透政治，而昌大却觉得唯有当官才能报效国家。师徒二人分道扬镳后，昌大当官受到打击，而丁若铨却坚持着完成了他的著作。现在来看丁若铨的思想还是比较先进的，可惜生不逢时，能够潜心专研写书也是他心态好的一种表现。两百年过去，多大的官都早已作古，唯有书本流传了下来。黑白画面，说话也文绉绉，没想到这部电影还挺好看的，有不错的趣味性。
四星
若铨说:比起参透善变难懂的复杂人类，
不得不说，韩国电影的水准，我们差的好远。
“君子和而不流，中立而不倚，国有道，不变塞焉，国无道，至死不变。”
千百年来，人性不曾改，政治也就不曾改，一代一代只是重复不是前进。自我与时代的对抗，虽注定失败，但却无比闪亮。因此，结尾才让人如此动容。要说，这部如诗如画浪漫理想主义作品也有缺点，即对于出世入世的讨论过于追求戏剧化。幸好，两位优秀的男演员撑住了两个人物。
前有《思悼》，后有《兹山鱼谱》，在对国家过往儒家文化的深刻反思这一方面，韩国竟然又一次走在了中华文化圈的前列
昌大不去碰个头破血流不会真正认同老师的想法，丁若铨不像弟弟那样著书立说因为看透了现实，知道自己的理想是超前的，学贯东西又如何依旧改变不了什么，那就踏实研究那些透明的事物专心编本鱼谱，也是有意义的吧
这哪是什么儒学电影，精神内核还是在批判“封建社会”。史实的丁若铨我不了解，片中的丁若铨明显被编导安排成“被压抑的现代性”的化身（连地球仪都出现了），加上弟子出仕后情节太过刻意，感觉用力过猛。
看罢感慨良多。“帝国最优秀的人才却与鱼虾相伴”。想起韩昌黎的诗：“嗟哉吾党二三子，安得至老不更归。”《兹山鱼谱》用汉语写成，去年点校了一部分，国内还没出过。
古朴的影像，匠心独具的拍摄手法，一种浪漫的情怀又痛彻心扉的顿悟。工整又整齐的排列组合。技法成熟表演圆润情感饱满。
引进西方科学没问题，宣扬天主宗教就是傻逼。
黑白画面将汉字、汉诗及中式古典文人山水的美尽情展现。但故事缺乏力度，人物性格也不够鲜明。总之，形式大于内容。
去掉那一点基督教成分后就成了《大明王朝》的某个篇章。还是比较动人的
兹山鱼谱的意义，本身在于兹山，而非鱼谱。本以为著书立说是为了流芳百世，却不想其实是为了教化世人。有入世才能有出世，昌大已经走过一回了。故事其实更加向是生活流，但是顺畅不拧巴，感情也够真挚，但愿能多拿奖。这应该真的就是韩国电影今年最佳了。
对那个来说是罪人，来到我家就是客人。朴实的妇人明白，但许多人不明白。
好劇本。那騰起的青鳥，那最後一抹純淨的藍，都是心的訴求：我不能改變，我也不願同流合污。我不能按照所學而生活，我就按照自己的性格生活。
4.5 “如鹤一般活着固然好，但就算沾满了泥水和污水，也要像来者不拒的兹山一样，做一个黑色的无名之人，这应该也是有意义的吧。”
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